Свежие тепловыделяющие кассеты (ТВК), поступившие на АЭС с завода-изготовителя, хранятся в герметичных контейнерах на объектовом складе свежего топлива.

Склад свежего топлива располагается выше нулевой отметки в незатопляемой зоне. Свежие ТВК в радиационном отношении безвредны для персонала АЭС и окружающей среды.

Для хранения отработавших ТВК на каждом энергоблоке предусмотрено 2 бассейна выдержки, расположенные рядом с реактором в центральном зале. Бассейны выдержки имеют насосно-теплообменную установку для отвода остаточных тепловыделений в отработанном ядерном топливе. ТВК хранятся в герметичных пеналах под уровнем воды. Емкость обоих бассейнов выдержки обеспечивает возможность одновременного хранения полной топливной загрузки реактора, что соответствует количеству выгружаемых из реактора ТВК за четыре года работы на полной мощности.

Ориентировочное время выдержки ТВК в бассейне выдержки составляет около двух лет. По прошествии этого периода осуществляется перевод ТВК в хранилище отработанного ядерного топлива.

Перед транспортировкой топливная кассета отделяется от подвески с помощью механизма резки. Подвески после дезактивации направляются на повторное использование, а топливные кассеты загружаются в охлаждаемый контейнер специального вагона-контейнера. В приемном отделении хранилища, куда подается вагон-контейнер, топливные кассеты помещаются в пеналы и поступают на длительное хранение в заполненные водой отсеки хранилища.

C 1995 года на ЛАЭС осуществляется программа по реализации способа длительного (не менее 50 лет) безопасного контролируемого "сухого" хранения отработавшего топлива в металлобетонных контейнерах (МБК), пригодных также для целей транспортировки ОЯТ в централизованное хранилище  для последующей переработки. Опытный образец контейнера уже изготовлен и прошел испытания.

В Госатомнадзор направлен на экспертизу проект серийного контейнера ТУК-104 на 57 ОТВС.

Принципиальным решением является размещение каждого пучка твэлов в ампулах, предотвращающих просыпи топлива в контейнер      и гарантированно обеспечивающих безопасность выгрузки топлива из контейнера и последующие операции с ним после 50 лет хранения.

В соответствие с "Программой по обращению ОЯТ и РАО на период 1997-2005 гг/", утвержденной Министерством РФ по атомной энергии, проведена реконструкция хранилищ ОЯТ в целях  увеличения вместимости. Приреакторные бассейны переведены на уплотненное хранение, при этом емкость бассейнов увеличена в 2 раза.

В станционном хранилище на уплотненное хранение на октябрь 2000 г. переведено около 14000 ОТВС. Полная вместимость станционного хранилища с уплотненным хранением составит не менее 35000 ОТВС.

Схема уплотненного хранения ОЯТ:

А - обычная; B - уплотнённая